El año 2018 fue muy difícil para Mariana Pajón, pues le descubrieron una mononucleosis y posteriormente sufrió la rotura del ligamento cruzado de la rodilla. Fue una recuperación bastante larga y dolorosa; pero, curiosamente le benefició que los Juegos Olímpicos se aplazaran para 2021.
En Tokio se llevó la medalla de plata y aseguró que ha sido la más especial que ganó por todo lo que tuvo que vivir. En algún momento hasta pensó si ya era suficiente en el BMX. Sin embargo, luchó y con 30 años sigue compitiendo al más alto nivel con grandes competidoras.
La séptima y octava válida de la Copa del Mundo de BMX se llevó a cabo en Sakarya, Turquía. Mariana Pajón ocupó el tercer lugar por detrás de Laura Smulders y Felicia Stancil en lo que era la última carrera del año.
Con ese puesto la colombiana sumó 815 puntos y es la mejor del mundo en la clasificación general del año 2021.
